Custom Master Page Add an app Loading Page Issue

Add the below snippet at the proper place in your custom master page will solve you problem

 <div id="s4-workspace">
            <div id="s4-bodyContainer">
           
         
               <div class="ms-dialogHidden" style="display:none;">
                            <h1 id="pageTitle" class="ms-core-pageTitle">
                                <!-- ===== STARTER: Needed for Adding Apps from Site Contents ======================================================================================= -->
                                <!--SPM:<SharePoint:AjaxDelta id="DeltaPlaceHolderPageTitleInTitleArea" runat="server">-->
                                <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder id="PlaceHolderPageTitleInTitleArea" runat="server">-->
                                    <!--SPM:<SharePoint:SPTitleBreadcrumb runat="server" RenderCurrentNodeAsLink="true" SiteMapProvider="SPContentMapProvider" CentralAdminSiteMapProvider="SPXmlAdminContentMapProvider">-->
                                        <!--SPM:<PATHSEPARATORTEMPLATE>-->
                                            <!--SPM:<SharePoint:ClusteredDirectionalSeparatorArrow runat="server"/>-->
                                        <!--SPM:</PATHSEPARATORTEMPLATE>-->
                                    <!--SPM:</SharePoint:SPTitleBreadcrumb>-->
                                <!--SPM:</asp:ContentPlaceHolder>-->
                                <!--SPM:</SharePoint:AjaxDelta>-->   
                                <div class="ms-displayInlineBlock ms-normalWrap">
                                    <a href="javascript:;" id="ms-pageDescriptionDiv" style="display:none;">
                                        <span id="ms-pageDescriptionImage">&#160;</span>
                                    </a>
                                    <span class="ms-accessible" id="ms-pageDescription">
                                        <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder id="PlaceHolderPageDescription" runat="server"/>-->
                                    </span>
                                    <!--SPM:<SharePoint:ScriptBlock runat="server">-->
                                        <!--SPM:_spBodyOnLoadFunctionNames.push("setupPageDescriptionCallout");-->
                                    <!--SPM:</SharePoint:ScriptBlock>-->
                                </div>
                            </h1>
                        </div>
                       
           
            <div id="sideNavBox" class="ms-dialogHidden ms-forceWrap ms-noList" style="display:none;">
                        <div class="ms-core-navigation">
                            <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder ID="PlaceHolderLeftNavBar" runat="server">-->
                                <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder ID="PlaceHolderLeftNavBarTop" runat="server">-->
                                    <!-- ===== STARTER: hide the quick launch for any page the doesn't override the PlaceHolderLeftNavBar ============ -->
                                    <!-- ===== STARTER: if you want the navigation back you can add it from the collab master ============ -->
                                    <!--SPM:<style type="text/css">//<![CDATA[-->
                                        <!--SPM:#contentBox { margin-left: 0; }-->
                                        <!--SPM:#sideNavBox { display: none; }-->
                                    <!--SPM://]]></style>-->
                                <!--SPM:</asp:ContentPlaceHolder>-->
                                <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder ID="PlaceHolderQuickLaunchTop" runat="server"/>-->
                                <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder ID="PlaceHolderLeftNavBarDataSource" runat="server"/>-->
                                <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder ID="PlaceHolderCalendarNavigator" runat="server"/>-->
                                <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder ID="PlaceHolderLeftActions" runat="server"/>-->
                                <!--SPM:<asp:ContentPlaceHolder ID="PlaceHolderQuickLaunchBottom" runat="server"/>-->
                            <!--SPM:</asp:ContentPlaceHolder>-->
                        </div>
                    </div>

// other content

</div>
</div>